主要区别有以下两点。
第一 准入限制不同
中超有严格的准入条件限制，而足协杯则无，但凡在中国足协注册的球队皆可报名。
第二 赛制不同
中超联赛采用主客场胜3平1负0的积分赛制; 而足协杯采用的是单败淘汰赛制。
中国足球协会超级联赛（简称“中超”或“中超联赛”）是中国大陆地区最高级别的职业足球联赛。
中国足球协会杯赛（Chinese Football Association Cup，缩写：CFA Cup，简称：中国足协杯），是中国足球协会举办的国内男子足球最高水平的淘汰制足球杯赛。
区别是：中超采用联赛赛制，足协杯是采用杯赛赛制。
中超有升降级，足协杯没有升降级。
中超只有16只队伍，足协杯有72只队伍。
区别在于重要性不同，联赛最重要。中超是中超级别球队参加的国内最高级别联赛 ，属于循环赛。中超杯只有中超球队参加的杯赛，属于淘汰赛。足协杯是中超中甲球队都参加的杯赛，属于淘汰赛。
中超杯和足协杯的区别在于：
1、中超联赛杯，简称中超杯，是由中国足球协会主办的由中超联赛球队参加的淘汰制足球杯赛；
2、中超联赛杯为了给中超联赛的俱乐部调整比赛节奏，可以将它理解为中超联赛的一个配套赛事；
3、中国足球协会杯赛，简称为中国足协杯，是中国足球协会举办的国内男子足球最高水平的淘汰制足球杯赛。
中超足协杯赛程不冲突。根据中国足协的统筹安排，各只球队参加中超联赛和中国足协杯的时间不会冲突，只是各只球队的赛程比较紧，比赛任务繁重。所以中超足协杯赛程不冲突。
2023中国足协杯竞赛规程公布，新赛季足协杯计划于5月17日开赛，将进行7轮共63场淘汰赛，全部为单场对决！将有来自全国的64支球队参赛，包括中超、中甲、中乙、业余各16支球队。各级球队将分主客场对决厮杀，除决赛外，低级别球队遇高级别球队时将拥有主场优先权。
